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1997年首批入选百、记忆千、万人才工程第一、二层次。自行2013年获中国分析测试协会科学技术奖(CAIA)一等奖(第二获奖人)。此外,国永还多次获中科院优秀导师奖。
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自行2017年获得德国洪堡研究奖(HumboldtResearchAward)。
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